Η συλλογή των αγγειόσπερμων-δικοτυλήδονων φυτών περιλαμβάνει πολλές οικογένειες. Από αυτές συχνότερα εμφανίζονται στο Απολιθωμένο Δάσος οι δαφνίδες (Lauraceae) και οι φηγίδες (Fagaceae) που ανήκουν στα δικοτυλήδονα. Στις δαφνίδες ανήκουν πολλά είδη δάφνης και κανέλας, ενώ στις φηγίδες ανήκουν είδη βαλανιδιάς, καστανιάς και οξιάς. Στις εβενίδες (Ebenaceae) περιλαμβάνεται ο λωτός (Diospyros), στις σαλικίδες (Salicaceae) ανήκουν είδη ιτιάς και λεύκης και στις βετουλίδες (Betulaceae) περιλαμβάνεται η σημίδα, το σκλήθρο και ο γαύρος. Στη συλλογή περιλαμβάνονται επίσης είδη φυτών όπως η φλαμουριά (τίλιο), ο πλάτανος, ο βάτος, ο ρους.