Στη συλλογή των κωνοφόρων του Μουσείου περιλαμβάνονται οι οικογένειες των πευκίδων (Pinaceae), του τάξου (Taxaceae) και των κυπαρισσίδων (Cuprassaceae). Στις κυπαρισσίδες περιλαμβάνεται και η αρχέγονη οικογένεια των Ταξοδιείδων (Taxodiaceae), στην οποία περιλαμβάνονται είδη όπως η κουνινχάμια και οι προγονικές σεκόιες.

Οι προγονικές μορφές σεκόιες είναι τα εντυπωσιακότερα ευρήματα που περιλαμβάνονται στις συλλογές του Μουσείου και στις οποίες ανήκουν οι απολιθωμένοι κορμοί του Απολιθωμένου Δάσους Λέσβου με γιγαντιαίες διαστάσεις